|
|
|
|
|
|
|
|
Kuna genotüpiseerimise
tuumiklabor ostab teenuse pakkumiseks kiibid otse USAst, siis USD kursi
erinevuste tõttu pole ühest hinnakirja EEKides võimalik välja tuua.
Alljärgnevalt on eraldi välja toodud, millistest moodulitest teenuse
lõpphind formeerub. Tellimuse esitamiseks võtke palun ühendust Mari
Nelisega (tel. 7375880, marinel@ut.ee)
või Merike Leegoga (tel. 7375030,
merike.leego@ebc.ee).
Illumina hinnakiri (seisuga 14. juuni 2010):
* hinnale lisandub käibemaks 20%
Kiibid tellib üldjuhul tuumiklabor, kui aga soovite tellida kiipe otse, palun kontakteeruge kindlasti eelnevalt tuumiklaboriga selgitamaks võimalikke tööde teostamise aegu, sest kiipidega kaasatulevate kemikaalide säilivusaeg on ligikaudu 5-6 kuud. NB! Osade kiipidega saab analüüsida mitut proovi, seetõttu on välja toodud hind proovi kohta. Täpsemat infot kiipide kohta leiate Illumina kodulehelt www.illumina.com või klikkides konkreetse kiibi nimetusele ülal olevas hinnakirjas. Kiipide tellimine võtab aega ligikaudu 1-2 kuud, labori ressursid võimaldavad analüüsida 48 kiipi nädalas. Geeniekspressiooni kiibid on 6, 8 või 12 proovi jaoks, genotüpiseerimise kiibid kahe või nelja proovi jaoks olenevalt kiibi tüübist. Konkreetse töö tähtaeg oleneb sellest kui palju projekte on parasjagu tegemisel. Soovikorral on võimalik tellida meie käest RNA eraldamise teenust ning RNA ja DNA kontsentratsiooni määramise teenust. cRNA sünteesiks kasutame Ambion® Illumina TotalPrep RNA Amplification Kiti, 1 proovi hind on 650 kr. (sisaldab km.) RNA kontsentratsiooni määramiseks Agilent 2100 Analyzeril kasutame Agilent RNA 6000 Nano Kit'i (12-proovine kiip), 1 proovi hind on 100 kr. (sisaldab km). Minimaalne kogus 12 proovi või selle kordne arv. Märjalabori teenustasu Teenustasu sisaldab märjalabori
kulusid, üle antakse toorandmetega fail. Hinnad on erinevate kiipide puhul
mõnevõrra erinevad. Käibemaks Illumina kiipide ja märja labori hinnale lisandub käibemaks 20%. Tippkeskuse ja Euroopa Liidu grantide puhul on võimalik käibemaks Archimedesest tagasi taotleda. Andmete analüüsiteenus Soovikorral on võimalik lisaks tellida andmete analüüsiteenust. 1 proovi andmete analüüsi hind on 1 000 EEK'i (lisandub km). Koopiaarvu analüüsi saab teha vaid ühekaupa, genotüpiseerimise ja geeniekspressiooni andmete analüüsi osaliselt paralleelselt, seega suuremate mahtude korral palun küsige eraldi hinnapakkumist. Illumina kiibiandmete
esmaseks analüüsimiseks kasutame Illumina BeadStudio programmi.
Statistiliseks analüüsiks kasutame SASil põhinevat JMPGenomics'it, SPSS-i,
R-i, GeneSpring GXi ja PLINKi.
|
|
|
